Protein–RNA interactions for Protein: P62079

TSPAN5, Tetraspanin-5, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN5P62079 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN5P62079 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TSPAN5P62079 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN5P62079 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN5P62079 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN5P62079 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN5P62079 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN5P62079 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN5P62079 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN5P62079 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN5P62079 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN5P62079 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN5P62079 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN5P62079 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN5P62079 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN5P62079 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN5P62079 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN5P62079 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN5P62079 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN5P62079 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN5P62079 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN5P62079 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN5P62079 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPAN5P62079 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPAN5P62079 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPAN5P62079 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPAN5P62079 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSPAN5P62079 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSPAN5P62079 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSPAN5P62079 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSPAN5P62079 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSPAN5P62079 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSPAN5P62079 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSPAN5P62079 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSPAN5P62079 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSPAN5P62079 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSPAN5P62079 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSPAN5P62079 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms