Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPI1P60174 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPI1P60174 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPI1P60174 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPI1P60174 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPI1P60174 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPI1P60174 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPI1P60174 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPI1P60174 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPI1P60174 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPI1P60174 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPI1P60174 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPI1P60174 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPI1P60174 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPI1P60174 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPI1P60174 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPI1P60174 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPI1P60174 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TPI1P60174 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPI1P60174 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPI1P60174 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPI1P60174 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPI1P60174 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPI1P60174 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPI1P60174 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPI1P60174 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPI1P60174 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPI1P60174 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPI1P60174 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPI1P60174 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPI1P60174 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPI1P60174 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPI1P60174 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPI1P60174 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPI1P60174 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPI1P60174 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPI1P60174 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPI1P60174 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPI1P60174 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPI1P60174 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPI1P60174 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPI1P60174 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPI1P60174 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPI1P60174 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPI1P60174 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPI1P60174 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPI1P60174 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPI1P60174 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPI1P60174 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPI1P60174 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPI1P60174 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPI1P60174 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPI1P60174 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPI1P60174 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TPI1P60174 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPI1P60174 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPI1P60174 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPI1P60174 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPI1P60174 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TPI1P60174 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPI1P60174 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TPI1P60174 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPI1P60174 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPI1P60174 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPI1P60174 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPI1P60174 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TPI1P60174 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPI1P60174 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPI1P60174 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPI1P60174 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPI1P60174 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPI1P60174 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPI1P60174 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPI1P60174 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPI1P60174 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TPI1P60174 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPI1P60174 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPI1P60174 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPI1P60174 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPI1P60174 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPI1P60174 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPI1P60174 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPI1P60174 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPI1P60174 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPI1P60174 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPI1P60174 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPI1P60174 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPI1P60174 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPI1P60174 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPI1P60174 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPI1P60174 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPI1P60174 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPI1P60174 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPI1P60174 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPI1P60174 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPI1P60174 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPI1P60174 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPI1P60174 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPI1P60174 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TPI1P60174 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms