Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RTP1P59025 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RTP1P59025 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RTP1P59025 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RTP1P59025 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RTP1P59025 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTP1P59025 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTP1P59025 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTP1P59025 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTP1P59025 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTP1P59025 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTP1P59025 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTP1P59025 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTP1P59025 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTP1P59025 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTP1P59025 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTP1P59025 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTP1P59025 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTP1P59025 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTP1P59025 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTP1P59025 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RTP1P59025 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTP1P59025 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTP1P59025 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTP1P59025 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RTP1P59025 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTP1P59025 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTP1P59025 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTP1P59025 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTP1P59025 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RTP1P59025 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTP1P59025 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTP1P59025 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RTP1P59025 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTP1P59025 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTP1P59025 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTP1P59025 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTP1P59025 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RTP1P59025 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTP1P59025 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTP1P59025 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RTP1P59025 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RTP1P59025 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RTP1P59025 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RTP1P59025 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTP1P59025 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTP1P59025 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTP1P59025 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTP1P59025 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTP1P59025 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTP1P59025 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTP1P59025 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RTP1P59025 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTP1P59025 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTP1P59025 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTP1P59025 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RTP1P59025 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RTP1P59025 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RTP1P59025 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RTP1P59025 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTP1P59025 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTP1P59025 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTP1P59025 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTP1P59025 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTP1P59025 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTP1P59025 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTP1P59025 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTP1P59025 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RTP1P59025 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RTP1P59025 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RTP1P59025 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RTP1P59025 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTP1P59025 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTP1P59025 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RTP1P59025 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTP1P59025 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTP1P59025 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTP1P59025 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTP1P59025 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTP1P59025 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTP1P59025 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTP1P59025 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTP1P59025 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTP1P59025 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTP1P59025 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTP1P59025 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTP1P59025 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTP1P59025 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTP1P59025 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTP1P59025 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RTP1P59025 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RTP1P59025 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTP1P59025 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTP1P59025 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTP1P59025 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTP1P59025 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTP1P59025 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTP1P59025 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTP1P59025 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTP1P59025 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms