Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SOX10P56693 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SOX10P56693 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SOX10P56693 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SOX10P56693 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SOX10P56693 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SOX10P56693 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SOX10P56693 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SOX10P56693 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SOX10P56693 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SOX10P56693 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SOX10P56693 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SOX10P56693 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SOX10P56693 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SOX10P56693 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SOX10P56693 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SOX10P56693 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SOX10P56693 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SOX10P56693 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SOX10P56693 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SOX10P56693 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SOX10P56693 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SOX10P56693 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SOX10P56693 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SOX10P56693 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SOX10P56693 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SOX10P56693 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SOX10P56693 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SOX10P56693 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SOX10P56693 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SOX10P56693 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SOX10P56693 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SOX10P56693 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SOX10P56693 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SOX10P56693 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SOX10P56693 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SOX10P56693 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SOX10P56693 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SOX10P56693 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SOX10P56693 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SOX10P56693 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SOX10P56693 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SOX10P56693 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SOX10P56693 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SOX10P56693 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SOX10P56693 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SOX10P56693 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SOX10P56693 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SOX10P56693 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SOX10P56693 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SOX10P56693 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SOX10P56693 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SOX10P56693 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SOX10P56693 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SOX10P56693 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SOX10P56693 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SOX10P56693 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SOX10P56693 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SOX10P56693 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SOX10P56693 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SOX10P56693 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SOX10P56693 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SOX10P56693 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SOX10P56693 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SOX10P56693 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SOX10P56693 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SOX10P56693 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SOX10P56693 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SOX10P56693 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SOX10P56693 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SOX10P56693 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SOX10P56693 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SOX10P56693 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SOX10P56693 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SOX10P56693 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SOX10P56693 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SOX10P56693 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SOX10P56693 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SOX10P56693 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SOX10P56693 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SOX10P56693 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SOX10P56693 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SOX10P56693 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SOX10P56693 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SOX10P56693 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SOX10P56693 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SOX10P56693 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SOX10P56693 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SOX10P56693 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
SOX10P56693 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SOX10P56693 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SOX10P56693 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SOX10P56693 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SOX10P56693 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SOX10P56693 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SOX10P56693 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SOX10P56693 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SOX10P56693 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SOX10P56693 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SOX10P56693 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms