Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GDF10P55107 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDF10P55107 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDF10P55107 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDF10P55107 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDF10P55107 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDF10P55107 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDF10P55107 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDF10P55107 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDF10P55107 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDF10P55107 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDF10P55107 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GDF10P55107 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GDF10P55107 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GDF10P55107 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GDF10P55107 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDF10P55107 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDF10P55107 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDF10P55107 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GDF10P55107 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDF10P55107 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF10P55107 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF10P55107 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF10P55107 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF10P55107 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF10P55107 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF10P55107 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF10P55107 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF10P55107 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF10P55107 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF10P55107 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF10P55107 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF10P55107 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF10P55107 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF10P55107 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF10P55107 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF10P55107 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF10P55107 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF10P55107 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF10P55107 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDF10P55107 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDF10P55107 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDF10P55107 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF10P55107 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF10P55107 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF10P55107 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF10P55107 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF10P55107 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF10P55107 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF10P55107 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF10P55107 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF10P55107 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
GDF10P55107 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF10P55107 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF10P55107 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDF10P55107 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDF10P55107 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF10P55107 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF10P55107 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF10P55107 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF10P55107 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF10P55107 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF10P55107 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF10P55107 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF10P55107 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF10P55107 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF10P55107 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDF10P55107 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDF10P55107 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDF10P55107 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDF10P55107 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDF10P55107 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF10P55107 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF10P55107 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF10P55107 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF10P55107 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF10P55107 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF10P55107 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF10P55107 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF10P55107 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF10P55107 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF10P55107 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF10P55107 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF10P55107 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF10P55107 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF10P55107 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF10P55107 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDF10P55107 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GDF10P55107 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GDF10P55107 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDF10P55107 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDF10P55107 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDF10P55107 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDF10P55107 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDF10P55107 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDF10P55107 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDF10P55107 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF10P55107 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF10P55107 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF10P55107 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms