Protein–RNA interactions for Protein: P55042

RRAD, GTP-binding protein RAD, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRADP55042 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRADP55042 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRADP55042 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRADP55042 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRADP55042 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRADP55042 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRADP55042 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRADP55042 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RRADP55042 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRADP55042 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRADP55042 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRADP55042 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRADP55042 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRADP55042 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRADP55042 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRADP55042 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRADP55042 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRADP55042 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRADP55042 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRADP55042 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRADP55042 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRADP55042 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRADP55042 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRADP55042 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRADP55042 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRADP55042 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRADP55042 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRADP55042 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRADP55042 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRADP55042 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRADP55042 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRADP55042 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRADP55042 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRADP55042 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RRADP55042 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRADP55042 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRADP55042 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRADP55042 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRADP55042 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRADP55042 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRADP55042 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRADP55042 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RRADP55042 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRADP55042 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRADP55042 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RRADP55042 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRADP55042 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRADP55042 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRADP55042 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRADP55042 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRADP55042 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRADP55042 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRADP55042 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRADP55042 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRADP55042 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRADP55042 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRADP55042 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RRADP55042 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRADP55042 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RRADP55042 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RRADP55042 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RRADP55042 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRADP55042 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRADP55042 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RRADP55042 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRADP55042 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRADP55042 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRADP55042 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRADP55042 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRADP55042 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRADP55042 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRADP55042 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RRADP55042 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRADP55042 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRADP55042 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RRADP55042 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRADP55042 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRADP55042 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRADP55042 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRADP55042 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRADP55042 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RRADP55042 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRADP55042 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRADP55042 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRADP55042 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRADP55042 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRADP55042 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RRADP55042 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRADP55042 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRADP55042 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRADP55042 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RRADP55042 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRADP55042 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RRADP55042 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRADP55042 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRADP55042 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRADP55042 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRADP55042 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RRADP55042 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRADP55042 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms