Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COPB1P53618 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COPB1P53618 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COPB1P53618 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COPB1P53618 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COPB1P53618 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COPB1P53618 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COPB1P53618 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COPB1P53618 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COPB1P53618 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COPB1P53618 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COPB1P53618 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COPB1P53618 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COPB1P53618 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COPB1P53618 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COPB1P53618 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
COPB1P53618 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COPB1P53618 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COPB1P53618 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COPB1P53618 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COPB1P53618 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
COPB1P53618 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COPB1P53618 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
COPB1P53618 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COPB1P53618 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COPB1P53618 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COPB1P53618 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COPB1P53618 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COPB1P53618 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COPB1P53618 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COPB1P53618 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COPB1P53618 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COPB1P53618 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COPB1P53618 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COPB1P53618 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COPB1P53618 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COPB1P53618 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COPB1P53618 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COPB1P53618 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COPB1P53618 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COPB1P53618 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
COPB1P53618 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COPB1P53618 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COPB1P53618 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COPB1P53618 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
COPB1P53618 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COPB1P53618 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COPB1P53618 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COPB1P53618 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COPB1P53618 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COPB1P53618 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COPB1P53618 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COPB1P53618 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COPB1P53618 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COPB1P53618 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COPB1P53618 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COPB1P53618 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COPB1P53618 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COPB1P53618 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
COPB1P53618 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COPB1P53618 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COPB1P53618 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COPB1P53618 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COPB1P53618 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COPB1P53618 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COPB1P53618 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COPB1P53618 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COPB1P53618 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
COPB1P53618 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COPB1P53618 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COPB1P53618 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
COPB1P53618 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COPB1P53618 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
COPB1P53618 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COPB1P53618 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COPB1P53618 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COPB1P53618 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COPB1P53618 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COPB1P53618 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COPB1P53618 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COPB1P53618 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COPB1P53618 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COPB1P53618 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COPB1P53618 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COPB1P53618 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
COPB1P53618 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COPB1P53618 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COPB1P53618 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COPB1P53618 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COPB1P53618 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COPB1P53618 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COPB1P53618 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
COPB1P53618 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
COPB1P53618 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
COPB1P53618 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COPB1P53618 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COPB1P53618 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COPB1P53618 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COPB1P53618 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COPB1P53618 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms