Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB27AP51159 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB27AP51159 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB27AP51159 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB27AP51159 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB27AP51159 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RAB27AP51159 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB27AP51159 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB27AP51159 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB27AP51159 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB27AP51159 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB27AP51159 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB27AP51159 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB27AP51159 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB27AP51159 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB27AP51159 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB27AP51159 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB27AP51159 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB27AP51159 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB27AP51159 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB27AP51159 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB27AP51159 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB27AP51159 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB27AP51159 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB27AP51159 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB27AP51159 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB27AP51159 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB27AP51159 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB27AP51159 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB27AP51159 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB27AP51159 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB27AP51159 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB27AP51159 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB27AP51159 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB27AP51159 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB27AP51159 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB27AP51159 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB27AP51159 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB27AP51159 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB27AP51159 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB27AP51159 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB27AP51159 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB27AP51159 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB27AP51159 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB27AP51159 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB27AP51159 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB27AP51159 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB27AP51159 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB27AP51159 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB27AP51159 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB27AP51159 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB27AP51159 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB27AP51159 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB27AP51159 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB27AP51159 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms