Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSNK1EP49674 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSNK1EP49674 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSNK1EP49674 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CSNK1EP49674 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSNK1EP49674 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSNK1EP49674 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSNK1EP49674 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CSNK1EP49674 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSNK1EP49674 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CSNK1EP49674 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CSNK1EP49674 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSNK1EP49674 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSNK1EP49674 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CSNK1EP49674 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms