Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPAP49450 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPAP49450 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPAP49450 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPAP49450 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPAP49450 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPAP49450 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPAP49450 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPAP49450 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPAP49450 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPAP49450 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPAP49450 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPAP49450 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPAP49450 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPAP49450 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPAP49450 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPAP49450 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPAP49450 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPAP49450 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPAP49450 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPAP49450 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPAP49450 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPAP49450 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPAP49450 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPAP49450 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPAP49450 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPAP49450 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPAP49450 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPAP49450 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPAP49450 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPAP49450 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPAP49450 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPAP49450 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPAP49450 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPAP49450 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPAP49450 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPAP49450 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPAP49450 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPAP49450 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPAP49450 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPAP49450 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPAP49450 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPAP49450 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPAP49450 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPAP49450 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPAP49450 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPAP49450 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPAP49450 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPAP49450 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPAP49450 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPAP49450 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPAP49450 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPAP49450 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPAP49450 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPAP49450 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPAP49450 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPAP49450 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPAP49450 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPAP49450 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPAP49450 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPAP49450 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPAP49450 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPAP49450 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPAP49450 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPAP49450 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPAP49450 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPAP49450 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPAP49450 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPAP49450 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPAP49450 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPAP49450 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPAP49450 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPAP49450 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPAP49450 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPAP49450 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPAP49450 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPAP49450 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPAP49450 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPAP49450 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPAP49450 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPAP49450 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPAP49450 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPAP49450 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPAP49450 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPAP49450 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPAP49450 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPAP49450 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPAP49450 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPAP49450 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPAP49450 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPAP49450 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPAP49450 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPAP49450 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPAP49450 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPAP49450 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPAP49450 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPAP49450 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPAP49450 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPAP49450 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPAP49450 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms