Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRAPPC10P48553 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRAPPC10P48553 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC10P48553 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRAPPC10P48553 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
TRAPPC10P48553 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC10P48553 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC10P48553 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC10P48553 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC10P48553 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC10P48553 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC10P48553 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC10P48553 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC10P48553 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC10P48553 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC10P48553 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC10P48553 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC10P48553 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC10P48553 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC10P48553 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC10P48553 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC10P48553 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC10P48553 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC10P48553 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC10P48553 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRAPPC10P48553 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC10P48553 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC10P48553 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC10P48553 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC10P48553 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC10P48553 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC10P48553 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC10P48553 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC10P48553 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC10P48553 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 604.3 ms