Protein–RNA interactions for Protein: P47224

RABIF, Guanine nucleotide exchange factor MSS4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABIFP47224 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABIFP47224 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RABIFP47224 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABIFP47224 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABIFP47224 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABIFP47224 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABIFP47224 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABIFP47224 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABIFP47224 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RABIFP47224 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABIFP47224 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RABIFP47224 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABIFP47224 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RABIFP47224 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABIFP47224 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABIFP47224 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABIFP47224 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABIFP47224 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABIFP47224 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABIFP47224 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABIFP47224 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABIFP47224 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABIFP47224 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABIFP47224 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABIFP47224 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABIFP47224 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABIFP47224 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABIFP47224 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RABIFP47224 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RABIFP47224 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABIFP47224 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABIFP47224 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RABIFP47224 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RABIFP47224 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RABIFP47224 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABIFP47224 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABIFP47224 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABIFP47224 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABIFP47224 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABIFP47224 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RABIFP47224 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABIFP47224 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABIFP47224 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RABIFP47224 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABIFP47224 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RABIFP47224 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABIFP47224 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABIFP47224 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABIFP47224 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABIFP47224 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABIFP47224 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABIFP47224 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABIFP47224 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABIFP47224 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABIFP47224 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABIFP47224 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABIFP47224 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABIFP47224 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABIFP47224 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABIFP47224 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABIFP47224 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABIFP47224 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABIFP47224 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABIFP47224 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABIFP47224 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RABIFP47224 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RABIFP47224 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABIFP47224 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RABIFP47224 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABIFP47224 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABIFP47224 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABIFP47224 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABIFP47224 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RABIFP47224 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABIFP47224 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABIFP47224 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABIFP47224 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABIFP47224 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABIFP47224 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABIFP47224 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABIFP47224 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RABIFP47224 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABIFP47224 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABIFP47224 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABIFP47224 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABIFP47224 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABIFP47224 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABIFP47224 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABIFP47224 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABIFP47224 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABIFP47224 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RABIFP47224 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABIFP47224 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RABIFP47224 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABIFP47224 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABIFP47224 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABIFP47224 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABIFP47224 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABIFP47224 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RABIFP47224 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms