Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPL21P46778 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RPL21P46778 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RPL21P46778 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPL21P46778 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPL21P46778 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPL21P46778 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RPL21P46778 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPL21P46778 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPL21P46778 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPL21P46778 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPL21P46778 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPL21P46778 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPL21P46778 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPL21P46778 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPL21P46778 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPL21P46778 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPL21P46778 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPL21P46778 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPL21P46778 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPL21P46778 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPL21P46778 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPL21P46778 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RPL21P46778 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPL21P46778 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPL21P46778 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPL21P46778 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPL21P46778 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPL21P46778 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPL21P46778 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPL21P46778 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPL21P46778 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPL21P46778 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPL21P46778 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPL21P46778 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPL21P46778 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPL21P46778 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPL21P46778 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPL21P46778 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPL21P46778 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPL21P46778 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPL21P46778 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPL21P46778 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPL21P46778 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPL21P46778 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPL21P46778 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPL21P46778 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPL21P46778 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPL21P46778 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPL21P46778 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPL21P46778 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPL21P46778 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPL21P46778 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPL21P46778 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPL21P46778 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPL21P46778 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPL21P46778 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPL21P46778 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPL21P46778 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPL21P46778 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPL21P46778 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPL21P46778 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL21P46778 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL21P46778 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL21P46778 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL21P46778 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL21P46778 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL21P46778 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL21P46778 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL21P46778 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL21P46778 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL21P46778 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL21P46778 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL21P46778 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL21P46778 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL21P46778 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL21P46778 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL21P46778 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL21P46778 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL21P46778 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL21P46778 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL21P46778 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL21P46778 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL21P46778 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL21P46778 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL21P46778 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPL21P46778 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPL21P46778 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPL21P46778 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL21P46778 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL21P46778 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL21P46778 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL21P46778 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL21P46778 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL21P46778 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL21P46778 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL21P46778 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL21P46778 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL21P46778 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL21P46778 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms