Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPR4P46093 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPR4P46093 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPR4P46093 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPR4P46093 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPR4P46093 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPR4P46093 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPR4P46093 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPR4P46093 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GPR4P46093 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPR4P46093 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPR4P46093 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPR4P46093 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPR4P46093 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPR4P46093 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPR4P46093 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPR4P46093 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPR4P46093 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPR4P46093 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPR4P46093 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPR4P46093 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPR4P46093 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPR4P46093 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPR4P46093 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPR4P46093 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPR4P46093 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPR4P46093 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPR4P46093 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPR4P46093 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPR4P46093 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPR4P46093 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPR4P46093 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPR4P46093 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPR4P46093 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GPR4P46093 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPR4P46093 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPR4P46093 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPR4P46093 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GPR4P46093 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPR4P46093 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPR4P46093 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPR4P46093 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPR4P46093 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPR4P46093 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPR4P46093 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPR4P46093 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPR4P46093 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPR4P46093 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPR4P46093 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPR4P46093 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPR4P46093 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPR4P46093 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPR4P46093 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPR4P46093 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPR4P46093 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPR4P46093 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPR4P46093 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPR4P46093 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPR4P46093 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPR4P46093 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GPR4P46093 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPR4P46093 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPR4P46093 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GPR4P46093 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPR4P46093 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPR4P46093 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPR4P46093 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPR4P46093 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPR4P46093 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPR4P46093 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPR4P46093 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPR4P46093 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPR4P46093 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPR4P46093 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPR4P46093 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPR4P46093 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GPR4P46093 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPR4P46093 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPR4P46093 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPR4P46093 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPR4P46093 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPR4P46093 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPR4P46093 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPR4P46093 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPR4P46093 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPR4P46093 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPR4P46093 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GPR4P46093 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPR4P46093 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPR4P46093 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GPR4P46093 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPR4P46093 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPR4P46093 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPR4P46093 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPR4P46093 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPR4P46093 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPR4P46093 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPR4P46093 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GPR4P46093 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPR4P46093 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms