Protein–RNA interactions for Protein: P43378

PTPN9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN9P43378 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN9P43378 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPN9P43378 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN9P43378 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN9P43378 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN9P43378 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN9P43378 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN9P43378 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN9P43378 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN9P43378 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN9P43378 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN9P43378 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN9P43378 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN9P43378 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN9P43378 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN9P43378 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN9P43378 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN9P43378 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN9P43378 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN9P43378 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN9P43378 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN9P43378 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN9P43378 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN9P43378 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN9P43378 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN9P43378 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN9P43378 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN9P43378 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN9P43378 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPN9P43378 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN9P43378 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN9P43378 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN9P43378 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN9P43378 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN9P43378 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN9P43378 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN9P43378 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN9P43378 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms