Protein–RNA interactions for Protein: P41970

ELK3, ETS domain-containing protein Elk-3, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK3P41970 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ELK3P41970 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ELK3P41970 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ELK3P41970 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ELK3P41970 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ELK3P41970 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ELK3P41970 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ELK3P41970 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ELK3P41970 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ELK3P41970 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ELK3P41970 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ELK3P41970 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ELK3P41970 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ELK3P41970 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ELK3P41970 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ELK3P41970 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ELK3P41970 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ELK3P41970 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ELK3P41970 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ELK3P41970 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ELK3P41970 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ELK3P41970 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ELK3P41970 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ELK3P41970 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ELK3P41970 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ELK3P41970 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ELK3P41970 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ELK3P41970 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ELK3P41970 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ELK3P41970 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ELK3P41970 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ELK3P41970 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ELK3P41970 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ELK3P41970 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ELK3P41970 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ELK3P41970 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ELK3P41970 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ELK3P41970 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ELK3P41970 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ELK3P41970 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ELK3P41970 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ELK3P41970 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ELK3P41970 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ELK3P41970 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ELK3P41970 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ELK3P41970 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ELK3P41970 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ELK3P41970 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ELK3P41970 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ELK3P41970 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ELK3P41970 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ELK3P41970 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ELK3P41970 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ELK3P41970 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ELK3P41970 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ELK3P41970 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ELK3P41970 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ELK3P41970 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ELK3P41970 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ELK3P41970 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ELK3P41970 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ELK3P41970 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ELK3P41970 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ELK3P41970 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ELK3P41970 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ELK3P41970 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ELK3P41970 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ELK3P41970 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ELK3P41970 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ELK3P41970 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ELK3P41970 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ELK3P41970 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ELK3P41970 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ELK3P41970 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ELK3P41970 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ELK3P41970 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ELK3P41970 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ELK3P41970 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ELK3P41970 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ELK3P41970 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ELK3P41970 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ELK3P41970 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELK3P41970 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELK3P41970 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELK3P41970 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELK3P41970 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELK3P41970 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELK3P41970 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELK3P41970 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELK3P41970 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELK3P41970 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELK3P41970 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELK3P41970 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELK3P41970 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELK3P41970 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELK3P41970 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ELK3P41970 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ELK3P41970 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ELK3P41970 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ELK3P41970 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.7 ms