Protein–RNA interactions for Protein: P41439

FOLR3, Folate receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR3P41439 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOLR3P41439 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOLR3P41439 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOLR3P41439 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOLR3P41439 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOLR3P41439 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOLR3P41439 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOLR3P41439 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOLR3P41439 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOLR3P41439 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOLR3P41439 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOLR3P41439 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOLR3P41439 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOLR3P41439 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FOLR3P41439 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOLR3P41439 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOLR3P41439 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOLR3P41439 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOLR3P41439 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms