Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GARSP41250 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GARSP41250 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GARSP41250 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GARSP41250 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GARSP41250 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GARSP41250 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GARSP41250 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GARSP41250 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GARSP41250 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GARSP41250 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GARSP41250 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GARSP41250 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GARSP41250 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GARSP41250 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GARSP41250 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GARSP41250 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GARSP41250 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GARSP41250 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GARSP41250 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GARSP41250 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GARSP41250 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GARSP41250 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GARSP41250 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GARSP41250 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GARSP41250 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GARSP41250 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GARSP41250 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GARSP41250 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GARSP41250 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GARSP41250 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GARSP41250 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GARSP41250 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GARSP41250 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GARSP41250 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GARSP41250 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GARSP41250 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GARSP41250 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GARSP41250 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GARSP41250 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GARSP41250 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GARSP41250 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GARSP41250 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GARSP41250 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GARSP41250 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GARSP41250 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GARSP41250 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GARSP41250 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GARSP41250 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GARSP41250 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GARSP41250 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GARSP41250 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GARSP41250 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GARSP41250 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GARSP41250 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GARSP41250 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GARSP41250 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GARSP41250 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GARSP41250 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GARSP41250 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GARSP41250 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GARSP41250 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GARSP41250 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GARSP41250 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GARSP41250 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GARSP41250 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GARSP41250 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GARSP41250 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GARSP41250 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GARSP41250 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GARSP41250 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GARSP41250 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GARSP41250 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GARSP41250 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GARSP41250 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GARSP41250 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GARSP41250 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GARSP41250 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GARSP41250 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GARSP41250 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GARSP41250 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GARSP41250 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GARSP41250 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GARSP41250 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GARSP41250 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GARSP41250 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GARSP41250 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GARSP41250 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GARSP41250 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GARSP41250 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GARSP41250 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GARSP41250 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GARSP41250 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GARSP41250 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GARSP41250 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GARSP41250 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GARSP41250 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GARSP41250 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GARSP41250 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GARSP41250 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms