Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARL1P40616 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARL1P40616 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL1P40616 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL1P40616 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL1P40616 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL1P40616 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL1P40616 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL1P40616 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL1P40616 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL1P40616 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARL1P40616 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARL1P40616 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARL1P40616 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARL1P40616 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARL1P40616 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARL1P40616 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARL1P40616 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARL1P40616 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARL1P40616 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARL1P40616 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARL1P40616 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARL1P40616 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARL1P40616 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARL1P40616 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARL1P40616 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARL1P40616 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARL1P40616 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARL1P40616 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARL1P40616 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARL1P40616 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARL1P40616 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARL1P40616 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARL1P40616 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARL1P40616 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARL1P40616 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARL1P40616 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARL1P40616 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARL1P40616 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARL1P40616 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARL1P40616 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARL1P40616 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARL1P40616 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARL1P40616 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARL1P40616 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARL1P40616 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARL1P40616 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARL1P40616 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARL1P40616 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARL1P40616 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARL1P40616 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARL1P40616 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARL1P40616 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARL1P40616 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARL1P40616 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARL1P40616 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARL1P40616 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARL1P40616 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARL1P40616 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARL1P40616 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARL1P40616 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARL1P40616 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARL1P40616 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARL1P40616 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARL1P40616 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARL1P40616 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARL1P40616 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARL1P40616 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARL1P40616 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARL1P40616 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARL1P40616 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARL1P40616 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARL1P40616 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARL1P40616 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARL1P40616 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARL1P40616 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARL1P40616 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARL1P40616 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARL1P40616 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARL1P40616 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARL1P40616 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARL1P40616 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARL1P40616 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARL1P40616 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARL1P40616 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARL1P40616 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARL1P40616 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARL1P40616 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARL1P40616 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARL1P40616 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARL1P40616 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARL1P40616 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARL1P40616 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARL1P40616 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARL1P40616 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARL1P40616 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARL1P40616 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARL1P40616 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARL1P40616 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARL1P40616 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms