Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PBX1P40424 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PBX1P40424 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PBX1P40424 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PBX1P40424 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBX1P40424 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBX1P40424 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBX1P40424 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBX1P40424 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PBX1P40424 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PBX1P40424 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PBX1P40424 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PBX1P40424 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PBX1P40424 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PBX1P40424 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PBX1P40424 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PBX1P40424 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PBX1P40424 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PBX1P40424 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PBX1P40424 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PBX1P40424 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PBX1P40424 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PBX1P40424 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PBX1P40424 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PBX1P40424 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PBX1P40424 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PBX1P40424 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PBX1P40424 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PBX1P40424 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PBX1P40424 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PBX1P40424 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PBX1P40424 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PBX1P40424 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PBX1P40424 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PBX1P40424 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PBX1P40424 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PBX1P40424 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PBX1P40424 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PBX1P40424 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PBX1P40424 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PBX1P40424 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PBX1P40424 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PBX1P40424 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PBX1P40424 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PBX1P40424 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PBX1P40424 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PBX1P40424 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PBX1P40424 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PBX1P40424 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PBX1P40424 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PBX1P40424 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PBX1P40424 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PBX1P40424 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PBX1P40424 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PBX1P40424 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PBX1P40424 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PBX1P40424 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PBX1P40424 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PBX1P40424 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PBX1P40424 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PBX1P40424 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PBX1P40424 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PBX1P40424 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PBX1P40424 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBX1P40424 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBX1P40424 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBX1P40424 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBX1P40424 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBX1P40424 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBX1P40424 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PBX1P40424 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBX1P40424 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBX1P40424 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PBX1P40424 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBX1P40424 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBX1P40424 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBX1P40424 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
PBX1P40424 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PBX1P40424 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PBX1P40424 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PBX1P40424 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PBX1P40424 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBX1P40424 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBX1P40424 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBX1P40424 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBX1P40424 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBX1P40424 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBX1P40424 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBX1P40424 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PBX1P40424 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PBX1P40424 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PBX1P40424 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PBX1P40424 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PBX1P40424 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PBX1P40424 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PBX1P40424 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PBX1P40424 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PBX1P40424 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PBX1P40424 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PBX1P40424 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms