Protein–RNA interactions for Protein: P34741

SDC2, Syndecan-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC2P34741 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDC2P34741 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SDC2P34741 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDC2P34741 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDC2P34741 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SDC2P34741 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDC2P34741 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDC2P34741 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDC2P34741 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDC2P34741 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDC2P34741 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDC2P34741 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDC2P34741 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDC2P34741 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDC2P34741 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDC2P34741 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDC2P34741 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDC2P34741 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDC2P34741 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDC2P34741 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDC2P34741 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDC2P34741 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDC2P34741 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDC2P34741 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDC2P34741 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDC2P34741 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDC2P34741 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDC2P34741 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDC2P34741 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDC2P34741 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDC2P34741 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDC2P34741 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDC2P34741 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDC2P34741 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDC2P34741 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDC2P34741 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDC2P34741 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDC2P34741 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDC2P34741 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDC2P34741 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SDC2P34741 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDC2P34741 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDC2P34741 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDC2P34741 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDC2P34741 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDC2P34741 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDC2P34741 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDC2P34741 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDC2P34741 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDC2P34741 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDC2P34741 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDC2P34741 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDC2P34741 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDC2P34741 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDC2P34741 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDC2P34741 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDC2P34741 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDC2P34741 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDC2P34741 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDC2P34741 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDC2P34741 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDC2P34741 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDC2P34741 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDC2P34741 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDC2P34741 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDC2P34741 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDC2P34741 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDC2P34741 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDC2P34741 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDC2P34741 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDC2P34741 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDC2P34741 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDC2P34741 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDC2P34741 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDC2P34741 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDC2P34741 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDC2P34741 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDC2P34741 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDC2P34741 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDC2P34741 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDC2P34741 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDC2P34741 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDC2P34741 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDC2P34741 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDC2P34741 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDC2P34741 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDC2P34741 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDC2P34741 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDC2P34741 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDC2P34741 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDC2P34741 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDC2P34741 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDC2P34741 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SDC2P34741 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDC2P34741 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SDC2P34741 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDC2P34741 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDC2P34741 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDC2P34741 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDC2P34741 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms