Protein–RNA interactions for Protein: P30939

HTR1F, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1FP30939 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1FP30939 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1FP30939 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR1FP30939 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR1FP30939 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR1FP30939 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR1FP30939 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR1FP30939 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR1FP30939 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR1FP30939 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR1FP30939 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR1FP30939 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1FP30939 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR1FP30939 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms