Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAMP1P23763 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VAMP1P23763 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAMP1P23763 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAMP1P23763 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAMP1P23763 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VAMP1P23763 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VAMP1P23763 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VAMP1P23763 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VAMP1P23763 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VAMP1P23763 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VAMP1P23763 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VAMP1P23763 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VAMP1P23763 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VAMP1P23763 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VAMP1P23763 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VAMP1P23763 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VAMP1P23763 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms