Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CA4P22748 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CA4P22748 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CA4P22748 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CA4P22748 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CA4P22748 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CA4P22748 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CA4P22748 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CA4P22748 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CA4P22748 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CA4P22748 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CA4P22748 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CA4P22748 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CA4P22748 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CA4P22748 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CA4P22748 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CA4P22748 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CA4P22748 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CA4P22748 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CA4P22748 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CA4P22748 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CA4P22748 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CA4P22748 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CA4P22748 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CA4P22748 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CA4P22748 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CA4P22748 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CA4P22748 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CA4P22748 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CA4P22748 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CA4P22748 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CA4P22748 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CA4P22748 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CA4P22748 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CA4P22748 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CA4P22748 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CA4P22748 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CA4P22748 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CA4P22748 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CA4P22748 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CA4P22748 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CA4P22748 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CA4P22748 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CA4P22748 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CA4P22748 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CA4P22748 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CA4P22748 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CA4P22748 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CA4P22748 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CA4P22748 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CA4P22748 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CA4P22748 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CA4P22748 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CA4P22748 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CA4P22748 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CA4P22748 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CA4P22748 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CA4P22748 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CA4P22748 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CA4P22748 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CA4P22748 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CA4P22748 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CA4P22748 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CA4P22748 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CA4P22748 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CA4P22748 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CA4P22748 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CA4P22748 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CA4P22748 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CA4P22748 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CA4P22748 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CA4P22748 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CA4P22748 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CA4P22748 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CA4P22748 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CA4P22748 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CA4P22748 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CA4P22748 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CA4P22748 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CA4P22748 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CA4P22748 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CA4P22748 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CA4P22748 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CA4P22748 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CA4P22748 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CA4P22748 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CA4P22748 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CA4P22748 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CA4P22748 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CA4P22748 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CA4P22748 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CA4P22748 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CA4P22748 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CA4P22748 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CA4P22748 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CA4P22748 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CA4P22748 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CA4P22748 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CA4P22748 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CA4P22748 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms