Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH2P19022 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH2P19022 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH2P19022 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH2P19022 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH2P19022 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH2P19022 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH2P19022 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH2P19022 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH2P19022 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH2P19022 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH2P19022 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH2P19022 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH2P19022 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH2P19022 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH2P19022 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH2P19022 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH2P19022 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH2P19022 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH2P19022 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH2P19022 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH2P19022 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH2P19022 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH2P19022 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH2P19022 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH2P19022 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH2P19022 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH2P19022 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH2P19022 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH2P19022 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH2P19022 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH2P19022 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH2P19022 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH2P19022 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH2P19022 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH2P19022 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH2P19022 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH2P19022 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH2P19022 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH2P19022 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH2P19022 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH2P19022 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH2P19022 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH2P19022 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH2P19022 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH2P19022 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH2P19022 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH2P19022 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH2P19022 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH2P19022 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH2P19022 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH2P19022 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH2P19022 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH2P19022 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH2P19022 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH2P19022 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH2P19022 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH2P19022 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH2P19022 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH2P19022 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH2P19022 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH2P19022 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH2P19022 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH2P19022 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH2P19022 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH2P19022 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH2P19022 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH2P19022 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH2P19022 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH2P19022 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH2P19022 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH2P19022 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH2P19022 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH2P19022 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH2P19022 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH2P19022 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH2P19022 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH2P19022 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH2P19022 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH2P19022 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH2P19022 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH2P19022 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH2P19022 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH2P19022 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH2P19022 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH2P19022 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH2P19022 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH2P19022 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH2P19022 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH2P19022 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH2P19022 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH2P19022 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH2P19022 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH2P19022 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH2P19022 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH2P19022 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH2P19022 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH2P19022 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH2P19022 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH2P19022 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms