Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GNB3P16520 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GNB3P16520 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GNB3P16520 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GNB3P16520 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GNB3P16520 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GNB3P16520 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GNB3P16520 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GNB3P16520 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GNB3P16520 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GNB3P16520 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GNB3P16520 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GNB3P16520 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GNB3P16520 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GNB3P16520 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GNB3P16520 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GNB3P16520 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GNB3P16520 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GNB3P16520 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GNB3P16520 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GNB3P16520 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GNB3P16520 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GNB3P16520 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GNB3P16520 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GNB3P16520 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GNB3P16520 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GNB3P16520 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GNB3P16520 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GNB3P16520 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GNB3P16520 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GNB3P16520 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GNB3P16520 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNB3P16520 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNB3P16520 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNB3P16520 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNB3P16520 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNB3P16520 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GNB3P16520 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNB3P16520 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNB3P16520 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNB3P16520 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GNB3P16520 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNB3P16520 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNB3P16520 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GNB3P16520 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNB3P16520 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNB3P16520 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNB3P16520 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNB3P16520 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNB3P16520 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNB3P16520 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNB3P16520 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNB3P16520 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNB3P16520 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GNB3P16520 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNB3P16520 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNB3P16520 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNB3P16520 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNB3P16520 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GNB3P16520 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GNB3P16520 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GNB3P16520 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GNB3P16520 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GNB3P16520 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GNB3P16520 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GNB3P16520 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GNB3P16520 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GNB3P16520 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GNB3P16520 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GNB3P16520 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GNB3P16520 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GNB3P16520 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GNB3P16520 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GNB3P16520 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GNB3P16520 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GNB3P16520 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GNB3P16520 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GNB3P16520 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GNB3P16520 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GNB3P16520 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GNB3P16520 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GNB3P16520 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GNB3P16520 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNB3P16520 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNB3P16520 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNB3P16520 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNB3P16520 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNB3P16520 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNB3P16520 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNB3P16520 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNB3P16520 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNB3P16520 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GNB3P16520 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GNB3P16520 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GNB3P16520 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GNB3P16520 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GNB3P16520 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GNB3P16520 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GNB3P16520 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GNB3P16520 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms