Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CREB1P16220 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CREB1P16220 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CREB1P16220 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CREB1P16220 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CREB1P16220 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CREB1P16220 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CREB1P16220 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CREB1P16220 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CREB1P16220 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CREB1P16220 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CREB1P16220 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB1P16220 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB1P16220 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB1P16220 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB1P16220 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB1P16220 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB1P16220 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CREB1P16220 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CREB1P16220 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CREB1P16220 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CREB1P16220 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CREB1P16220 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CREB1P16220 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CREB1P16220 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CREB1P16220 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CREB1P16220 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CREB1P16220 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CREB1P16220 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CREB1P16220 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREB1P16220 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREB1P16220 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREB1P16220 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREB1P16220 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREB1P16220 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREB1P16220 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CREB1P16220 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB1P16220 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB1P16220 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB1P16220 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREB1P16220 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREB1P16220 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREB1P16220 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREB1P16220 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREB1P16220 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREB1P16220 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CREB1P16220 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CREB1P16220 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CREB1P16220 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CREB1P16220 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CREB1P16220 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CREB1P16220 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CREB1P16220 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CREB1P16220 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREB1P16220 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREB1P16220 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREB1P16220 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREB1P16220 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CREB1P16220 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREB1P16220 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREB1P16220 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREB1P16220 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREB1P16220 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREB1P16220 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CREB1P16220 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CREB1P16220 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CREB1P16220 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CREB1P16220 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREB1P16220 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREB1P16220 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREB1P16220 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREB1P16220 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREB1P16220 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CREB1P16220 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CREB1P16220 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CREB1P16220 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CREB1P16220 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CREB1P16220 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CREB1P16220 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CREB1P16220 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CREB1P16220 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB1P16220 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB1P16220 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB1P16220 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB1P16220 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB1P16220 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CREB1P16220 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CREB1P16220 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CREB1P16220 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CREB1P16220 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CREB1P16220 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB1P16220 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB1P16220 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB1P16220 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB1P16220 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CREB1P16220 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB1P16220 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB1P16220 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB1P16220 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB1P16220 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms