Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNB1P11230 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNB1P11230 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNB1P11230 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNB1P11230 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNB1P11230 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNB1P11230 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNB1P11230 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNB1P11230 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNB1P11230 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNB1P11230 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNB1P11230 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNB1P11230 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNB1P11230 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNB1P11230 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNB1P11230 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNB1P11230 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNB1P11230 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNB1P11230 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNB1P11230 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNB1P11230 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNB1P11230 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms