Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNMA6AP0CW24 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNMA6AP0CW24 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNMA6AP0CW24 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PNMA6AP0CW24 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PNMA6AP0CW24 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PNMA6AP0CW24 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PNMA6AP0CW24 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNMA6AP0CW24 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PNMA6AP0CW24 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNMA6AP0CW24 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNMA6AP0CW24 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNMA6AP0CW24 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNMA6AP0CW24 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNMA6AP0CW24 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNMA6AP0CW24 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNMA6AP0CW24 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PNMA6AP0CW24 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PNMA6AP0CW24 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PNMA6AP0CW24 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PNMA6AP0CW24 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PNMA6AP0CW24 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PNMA6AP0CW24 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PNMA6AP0CW24 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PNMA6AP0CW24 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PNMA6AP0CW24 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PNMA6AP0CW24 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNMA6AP0CW24 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNMA6AP0CW24 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNMA6AP0CW24 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PNMA6AP0CW24 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PNMA6AP0CW24 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PNMA6AP0CW24 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PNMA6AP0CW24 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PNMA6AP0CW24 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PNMA6AP0CW24 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PNMA6AP0CW24 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PNMA6AP0CW24 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PNMA6AP0CW24 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PNMA6AP0CW24 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PNMA6AP0CW24 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PNMA6AP0CW24 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PNMA6AP0CW24 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PNMA6AP0CW24 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PNMA6AP0CW24 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PNMA6AP0CW24 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PNMA6AP0CW24 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PNMA6AP0CW24 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PNMA6AP0CW24 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PNMA6AP0CW24 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PNMA6AP0CW24 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PNMA6AP0CW24 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PNMA6AP0CW24 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PNMA6AP0CW24 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PNMA6AP0CW24 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PNMA6AP0CW24 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PNMA6AP0CW24 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PNMA6AP0CW24 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PNMA6AP0CW24 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PNMA6AP0CW24 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PNMA6AP0CW24 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PNMA6AP0CW24 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PNMA6AP0CW24 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PNMA6AP0CW24 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PNMA6AP0CW24 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 828.1 ms