Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DQB1P01920 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-DQB1P01920 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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