Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
POLR1AO95602 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
POLR1AO95602 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
POLR1AO95602 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
POLR1AO95602 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
POLR1AO95602 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
POLR1AO95602 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
POLR1AO95602 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
POLR1AO95602 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
POLR1AO95602 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
POLR1AO95602 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
POLR1AO95602 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
POLR1AO95602 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
POLR1AO95602 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
POLR1AO95602 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
POLR1AO95602 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
POLR1AO95602 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
POLR1AO95602 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
POLR1AO95602 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
POLR1AO95602 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
POLR1AO95602 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
POLR1AO95602 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
POLR1AO95602 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
POLR1AO95602 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
POLR1AO95602 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
POLR1AO95602 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
POLR1AO95602 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
POLR1AO95602 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
POLR1AO95602 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
POLR1AO95602 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
POLR1AO95602 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
POLR1AO95602 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
POLR1AO95602 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
POLR1AO95602 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
POLR1AO95602 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.73■■■■□ 3.47
POLR1AO95602 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
POLR1AO95602 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
POLR1AO95602 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
POLR1AO95602 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
POLR1AO95602 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
POLR1AO95602 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
POLR1AO95602 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
POLR1AO95602 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
POLR1AO95602 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
POLR1AO95602 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
POLR1AO95602 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
POLR1AO95602 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
POLR1AO95602 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
POLR1AO95602 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
POLR1AO95602 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
POLR1AO95602 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
POLR1AO95602 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
POLR1AO95602 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
POLR1AO95602 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
POLR1AO95602 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
POLR1AO95602 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
POLR1AO95602 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
POLR1AO95602 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
POLR1AO95602 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
POLR1AO95602 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
POLR1AO95602 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
POLR1AO95602 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
POLR1AO95602 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
POLR1AO95602 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
POLR1AO95602 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
POLR1AO95602 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
POLR1AO95602 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
POLR1AO95602 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
POLR1AO95602 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
POLR1AO95602 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
POLR1AO95602 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
POLR1AO95602 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
POLR1AO95602 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
POLR1AO95602 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
POLR1AO95602 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
POLR1AO95602 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
POLR1AO95602 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
POLR1AO95602 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
POLR1AO95602 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
POLR1AO95602 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
POLR1AO95602 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
POLR1AO95602 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
POLR1AO95602 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
POLR1AO95602 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
POLR1AO95602 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
POLR1AO95602 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
POLR1AO95602 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
POLR1AO95602 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
POLR1AO95602 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
POLR1AO95602 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
POLR1AO95602 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
POLR1AO95602 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
POLR1AO95602 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
POLR1AO95602 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
POLR1AO95602 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
POLR1AO95602 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
POLR1AO95602 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
POLR1AO95602 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
POLR1AO95602 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
POLR1AO95602 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms