Protein–RNA interactions for Protein: O75603

GCM2, Chorion-specific transcription factor GCMb, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM2O75603 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCM2O75603 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCM2O75603 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCM2O75603 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCM2O75603 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCM2O75603 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCM2O75603 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCM2O75603 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCM2O75603 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCM2O75603 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCM2O75603 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCM2O75603 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GCM2O75603 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCM2O75603 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCM2O75603 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCM2O75603 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCM2O75603 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCM2O75603 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCM2O75603 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCM2O75603 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCM2O75603 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCM2O75603 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCM2O75603 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCM2O75603 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GCM2O75603 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCM2O75603 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCM2O75603 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCM2O75603 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCM2O75603 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCM2O75603 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCM2O75603 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCM2O75603 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCM2O75603 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCM2O75603 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCM2O75603 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCM2O75603 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCM2O75603 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCM2O75603 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCM2O75603 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCM2O75603 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GCM2O75603 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GCM2O75603 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GCM2O75603 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCM2O75603 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCM2O75603 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCM2O75603 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCM2O75603 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCM2O75603 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GCM2O75603 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCM2O75603 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCM2O75603 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCM2O75603 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCM2O75603 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GCM2O75603 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCM2O75603 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCM2O75603 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCM2O75603 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCM2O75603 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCM2O75603 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCM2O75603 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GCM2O75603 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCM2O75603 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCM2O75603 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCM2O75603 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCM2O75603 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCM2O75603 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCM2O75603 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCM2O75603 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCM2O75603 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCM2O75603 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCM2O75603 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCM2O75603 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCM2O75603 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCM2O75603 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCM2O75603 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCM2O75603 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCM2O75603 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCM2O75603 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCM2O75603 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCM2O75603 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCM2O75603 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCM2O75603 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCM2O75603 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCM2O75603 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCM2O75603 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCM2O75603 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCM2O75603 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCM2O75603 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCM2O75603 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCM2O75603 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCM2O75603 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCM2O75603 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GCM2O75603 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GCM2O75603 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCM2O75603 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCM2O75603 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GCM2O75603 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GCM2O75603 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCM2O75603 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCM2O75603 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms