Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHL41O60662 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL41O60662 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms