Protein–RNA interactions for Protein: O60504

SORBS3, Vinexin, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3O60504 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SORBS3O60504 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SORBS3O60504 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SORBS3O60504 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SORBS3O60504 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SORBS3O60504 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SORBS3O60504 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SORBS3O60504 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SORBS3O60504 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SORBS3O60504 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SORBS3O60504 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SORBS3O60504 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SORBS3O60504 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SORBS3O60504 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SORBS3O60504 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SORBS3O60504 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SORBS3O60504 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SORBS3O60504 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SORBS3O60504 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SORBS3O60504 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SORBS3O60504 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SORBS3O60504 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SORBS3O60504 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SORBS3O60504 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SORBS3O60504 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SORBS3O60504 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SORBS3O60504 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SORBS3O60504 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SORBS3O60504 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SORBS3O60504 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SORBS3O60504 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SORBS3O60504 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SORBS3O60504 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SORBS3O60504 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SORBS3O60504 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SORBS3O60504 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SORBS3O60504 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SORBS3O60504 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SORBS3O60504 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SORBS3O60504 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms