Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SMARCA5O60264 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA5O60264 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA5O60264 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA5O60264 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA5O60264 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA5O60264 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA5O60264 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA5O60264 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA5O60264 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA5O60264 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA5O60264 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA5O60264 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA5O60264 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA5O60264 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA5O60264 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA5O60264 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
SMARCA5O60264 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA5O60264 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA5O60264 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA5O60264 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMARCA5O60264 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMARCA5O60264 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMARCA5O60264 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMARCA5O60264 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SMARCA5O60264 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SMARCA5O60264 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMARCA5O60264 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMARCA5O60264 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
SMARCA5O60264 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMARCA5O60264 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
SMARCA5O60264 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMARCA5O60264 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMARCA5O60264 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMARCA5O60264 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMARCA5O60264 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMARCA5O60264 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMARCA5O60264 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA5O60264 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA5O60264 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA5O60264 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA5O60264 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SMARCA5O60264 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SMARCA5O60264 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SMARCA5O60264 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SMARCA5O60264 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA5O60264 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA5O60264 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMARCA5O60264 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMARCA5O60264 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMARCA5O60264 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMARCA5O60264 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMARCA5O60264 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SMARCA5O60264 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SMARCA5O60264 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SMARCA5O60264 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SMARCA5O60264 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SMARCA5O60264 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMARCA5O60264 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
SMARCA5O60264 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMARCA5O60264 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMARCA5O60264 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMARCA5O60264 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMARCA5O60264 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMARCA5O60264 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMARCA5O60264 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SMARCA5O60264 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SMARCA5O60264 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SMARCA5O60264 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SMARCA5O60264 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SMARCA5O60264 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SMARCA5O60264 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SMARCA5O60264 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms