Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCO2O43819 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCO2O43819 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCO2O43819 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCO2O43819 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCO2O43819 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCO2O43819 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCO2O43819 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCO2O43819 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCO2O43819 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCO2O43819 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCO2O43819 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCO2O43819 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCO2O43819 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCO2O43819 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCO2O43819 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCO2O43819 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SCO2O43819 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCO2O43819 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCO2O43819 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCO2O43819 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCO2O43819 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCO2O43819 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCO2O43819 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCO2O43819 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCO2O43819 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCO2O43819 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCO2O43819 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCO2O43819 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCO2O43819 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCO2O43819 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCO2O43819 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCO2O43819 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCO2O43819 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCO2O43819 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCO2O43819 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCO2O43819 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCO2O43819 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCO2O43819 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCO2O43819 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCO2O43819 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SCO2O43819 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCO2O43819 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCO2O43819 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCO2O43819 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCO2O43819 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCO2O43819 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCO2O43819 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCO2O43819 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCO2O43819 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCO2O43819 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCO2O43819 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCO2O43819 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCO2O43819 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCO2O43819 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCO2O43819 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCO2O43819 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCO2O43819 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCO2O43819 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCO2O43819 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCO2O43819 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCO2O43819 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCO2O43819 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCO2O43819 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCO2O43819 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCO2O43819 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCO2O43819 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCO2O43819 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCO2O43819 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCO2O43819 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCO2O43819 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCO2O43819 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCO2O43819 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCO2O43819 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCO2O43819 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCO2O43819 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCO2O43819 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCO2O43819 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCO2O43819 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCO2O43819 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCO2O43819 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCO2O43819 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCO2O43819 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCO2O43819 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCO2O43819 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCO2O43819 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCO2O43819 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCO2O43819 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCO2O43819 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCO2O43819 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCO2O43819 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCO2O43819 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCO2O43819 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCO2O43819 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCO2O43819 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCO2O43819 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCO2O43819 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCO2O43819 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCO2O43819 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCO2O43819 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms