Protein–RNA interactions for Protein: O43790

KRT86, Keratin, type II cuticular Hb6, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT86O43790 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT86O43790 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT86O43790 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT86O43790 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT86O43790 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT86O43790 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT86O43790 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT86O43790 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT86O43790 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT86O43790 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT86O43790 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT86O43790 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT86O43790 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT86O43790 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT86O43790 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT86O43790 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT86O43790 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT86O43790 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT86O43790 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT86O43790 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT86O43790 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT86O43790 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT86O43790 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT86O43790 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT86O43790 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT86O43790 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT86O43790 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT86O43790 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
KRT86O43790 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT86O43790 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT86O43790 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT86O43790 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT86O43790 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT86O43790 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT86O43790 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT86O43790 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT86O43790 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT86O43790 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT86O43790 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT86O43790 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT86O43790 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT86O43790 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT86O43790 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT86O43790 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT86O43790 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT86O43790 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT86O43790 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
KRT86O43790 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT86O43790 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT86O43790 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT86O43790 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT86O43790 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT86O43790 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT86O43790 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT86O43790 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT86O43790 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT86O43790 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT86O43790 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT86O43790 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT86O43790 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT86O43790 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT86O43790 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT86O43790 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT86O43790 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT86O43790 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT86O43790 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT86O43790 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT86O43790 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT86O43790 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT86O43790 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT86O43790 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT86O43790 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT86O43790 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT86O43790 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KRT86O43790 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT86O43790 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT86O43790 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT86O43790 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT86O43790 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT86O43790 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT86O43790 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT86O43790 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT86O43790 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT86O43790 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT86O43790 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT86O43790 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT86O43790 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT86O43790 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT86O43790 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT86O43790 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT86O43790 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT86O43790 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT86O43790 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT86O43790 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT86O43790 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT86O43790 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT86O43790 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT86O43790 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT86O43790 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT86O43790 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms