Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2DO15399 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN2DO15399 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN2DO15399 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIN2DO15399 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIN2DO15399 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIN2DO15399 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIN2DO15399 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIN2DO15399 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIN2DO15399 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIN2DO15399 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN2DO15399 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN2DO15399 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2DO15399 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2DO15399 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2DO15399 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2DO15399 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2DO15399 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2DO15399 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2DO15399 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2DO15399 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN2DO15399 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN2DO15399 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN2DO15399 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN2DO15399 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRIN2DO15399 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRIN2DO15399 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRIN2DO15399 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRIN2DO15399 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIN2DO15399 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIN2DO15399 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIN2DO15399 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN2DO15399 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN2DO15399 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN2DO15399 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN2DO15399 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN2DO15399 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2DO15399 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2DO15399 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2DO15399 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2DO15399 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2DO15399 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2DO15399 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GRIN2DO15399 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRIN2DO15399 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRIN2DO15399 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIN2DO15399 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIN2DO15399 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIN2DO15399 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIN2DO15399 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIN2DO15399 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIN2DO15399 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIN2DO15399 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIN2DO15399 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIN2DO15399 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN2DO15399 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN2DO15399 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN2DO15399 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN2DO15399 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN2DO15399 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN2DO15399 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN2DO15399 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN2DO15399 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIN2DO15399 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIN2DO15399 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIN2DO15399 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN2DO15399 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN2DO15399 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN2DO15399 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN2DO15399 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIN2DO15399 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.9 ms