Protein–RNA interactions for Protein: O15260

SURF4, Surfeit locus protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF4O15260 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SURF4O15260 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SURF4O15260 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SURF4O15260 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SURF4O15260 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SURF4O15260 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SURF4O15260 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SURF4O15260 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SURF4O15260 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SURF4O15260 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SURF4O15260 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SURF4O15260 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SURF4O15260 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SURF4O15260 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF4O15260 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF4O15260 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF4O15260 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF4O15260 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF4O15260 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF4O15260 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF4O15260 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF4O15260 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF4O15260 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF4O15260 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SURF4O15260 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SURF4O15260 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF4O15260 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF4O15260 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SURF4O15260 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SURF4O15260 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SURF4O15260 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SURF4O15260 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SURF4O15260 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SURF4O15260 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SURF4O15260 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SURF4O15260 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF4O15260 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF4O15260 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF4O15260 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF4O15260 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF4O15260 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF4O15260 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF4O15260 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF4O15260 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF4O15260 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF4O15260 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF4O15260 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SURF4O15260 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SURF4O15260 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SURF4O15260 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SURF4O15260 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SURF4O15260 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SURF4O15260 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SURF4O15260 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SURF4O15260 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SURF4O15260 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SURF4O15260 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SURF4O15260 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SURF4O15260 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SURF4O15260 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SURF4O15260 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SURF4O15260 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SURF4O15260 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SURF4O15260 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SURF4O15260 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SURF4O15260 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SURF4O15260 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SURF4O15260 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SURF4O15260 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SURF4O15260 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SURF4O15260 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SURF4O15260 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SURF4O15260 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SURF4O15260 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SURF4O15260 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SURF4O15260 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SURF4O15260 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SURF4O15260 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SURF4O15260 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SURF4O15260 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SURF4O15260 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SURF4O15260 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SURF4O15260 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SURF4O15260 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF4O15260 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF4O15260 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF4O15260 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF4O15260 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF4O15260 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF4O15260 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF4O15260 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF4O15260 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF4O15260 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF4O15260 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF4O15260 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF4O15260 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF4O15260 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF4O15260 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF4O15260 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF4O15260 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms