Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3QRK9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
J3QRK9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3QRK9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
J3QRK9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3QRK9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3QRK9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3QRK9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3QRK9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3QRK9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3QRK9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3QRK9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3QRK9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
J3QRK9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3QRK9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3QRK9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3QRK9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3QRK9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3QRK9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3QRK9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3QRK9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3QRK9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3QRK9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3QRK9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3QRK9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3QRK9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
J3QRK9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
J3QRK9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
J3QRK9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
J3QRK9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3QRK9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3QRK9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3QRK9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3QRK9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3QRK9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3QRK9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3QRK9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3QRK9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3QRK9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3QRK9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3QRK9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3QRK9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3QRK9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3QRK9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3QRK9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3QRK9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
J3QRK9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3QRK9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3QRK9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
J3QRK9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3QRK9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3QRK9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3QRK9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3QRK9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3QRK9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3QRK9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3QRK9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3QRK9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3QRK9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3QRK9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3QRK9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
J3QRK9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
J3QRK9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
J3QRK9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
J3QRK9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
J3QRK9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
J3QRK9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
J3QRK9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3QRK9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3QRK9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3QRK9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3QRK9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QRK9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QRK9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QRK9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QRK9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
J3QRK9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
J3QRK9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3QRK9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3QRK9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3QRK9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
J3QRK9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
J3QRK9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
J3QRK9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
J3QRK9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
J3QRK9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
J3QRK9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QRK9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QRK9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QRK9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QRK9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
J3QRK9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3QRK9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3QRK9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
J3QRK9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3QRK9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3QRK9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3QRK9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3QRK9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3QRK9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms