Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms