Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HNRNPCL3B7ZW38 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HNRNPCL3B7ZW38 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HNRNPCL3B7ZW38 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HNRNPCL3B7ZW38 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HNRNPCL3B7ZW38 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HNRNPCL3B7ZW38 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HNRNPCL3B7ZW38 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HNRNPCL3B7ZW38 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HNRNPCL3B7ZW38 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HNRNPCL3B7ZW38 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HNRNPCL3B7ZW38 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HNRNPCL3B7ZW38 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HNRNPCL3B7ZW38 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HNRNPCL3B7ZW38 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HNRNPCL3B7ZW38 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HNRNPCL3B7ZW38 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HNRNPCL3B7ZW38 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HNRNPCL3B7ZW38 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HNRNPCL3B7ZW38 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HNRNPCL3B7ZW38 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HNRNPCL3B7ZW38 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HNRNPCL3B7ZW38 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HNRNPCL3B7ZW38 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HNRNPCL3B7ZW38 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HNRNPCL3B7ZW38 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HNRNPCL3B7ZW38 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HNRNPCL3B7ZW38 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HNRNPCL3B7ZW38 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HNRNPCL3B7ZW38 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HNRNPCL3B7ZW38 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HNRNPCL3B7ZW38 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms