Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOBPA7XYQ1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOBPA7XYQ1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SOBPA7XYQ1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOBPA7XYQ1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SOBPA7XYQ1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOBPA7XYQ1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOBPA7XYQ1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOBPA7XYQ1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOBPA7XYQ1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOBPA7XYQ1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOBPA7XYQ1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOBPA7XYQ1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOBPA7XYQ1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOBPA7XYQ1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOBPA7XYQ1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SOBPA7XYQ1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOBPA7XYQ1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SOBPA7XYQ1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOBPA7XYQ1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOBPA7XYQ1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOBPA7XYQ1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOBPA7XYQ1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOBPA7XYQ1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOBPA7XYQ1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOBPA7XYQ1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOBPA7XYQ1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SOBPA7XYQ1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOBPA7XYQ1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOBPA7XYQ1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOBPA7XYQ1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SOBPA7XYQ1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SOBPA7XYQ1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SOBPA7XYQ1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOBPA7XYQ1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOBPA7XYQ1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOBPA7XYQ1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms