Protein–RNA interactions for Protein: A6NI03

TRIM64B, Putative tripartite motif-containing protein 64B, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM64BA6NI03 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM64BA6NI03 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM64BA6NI03 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM64BA6NI03 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM64BA6NI03 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM64BA6NI03 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM64BA6NI03 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM64BA6NI03 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM64BA6NI03 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM64BA6NI03 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM64BA6NI03 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM64BA6NI03 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM64BA6NI03 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM64BA6NI03 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM64BA6NI03 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM64BA6NI03 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM64BA6NI03 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM64BA6NI03 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM64BA6NI03 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM64BA6NI03 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM64BA6NI03 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM64BA6NI03 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM64BA6NI03 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM64BA6NI03 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM64BA6NI03 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM64BA6NI03 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM64BA6NI03 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM64BA6NI03 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM64BA6NI03 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM64BA6NI03 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM64BA6NI03 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM64BA6NI03 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM64BA6NI03 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM64BA6NI03 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM64BA6NI03 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM64BA6NI03 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms