Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRAMEF25A6NGN4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF25A6NGN4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF25A6NGN4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF25A6NGN4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF25A6NGN4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF25A6NGN4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF25A6NGN4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF25A6NGN4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF25A6NGN4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF25A6NGN4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF25A6NGN4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF25A6NGN4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF25A6NGN4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF25A6NGN4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF25A6NGN4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF25A6NGN4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF25A6NGN4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF25A6NGN4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF25A6NGN4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF25A6NGN4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF25A6NGN4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF25A6NGN4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF25A6NGN4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF25A6NGN4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms