Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIT2A6NDA9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIT2A6NDA9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIT2A6NDA9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIT2A6NDA9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIT2A6NDA9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIT2A6NDA9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIT2A6NDA9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIT2A6NDA9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIT2A6NDA9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIT2A6NDA9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRIT2A6NDA9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRIT2A6NDA9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRIT2A6NDA9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRIT2A6NDA9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LRIT2A6NDA9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRIT2A6NDA9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRIT2A6NDA9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRIT2A6NDA9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRIT2A6NDA9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIT2A6NDA9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIT2A6NDA9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIT2A6NDA9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIT2A6NDA9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIT2A6NDA9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIT2A6NDA9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIT2A6NDA9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIT2A6NDA9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIT2A6NDA9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRIT2A6NDA9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms