Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VWA8A3KMH1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VWA8A3KMH1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VWA8A3KMH1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VWA8A3KMH1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VWA8A3KMH1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VWA8A3KMH1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VWA8A3KMH1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VWA8A3KMH1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VWA8A3KMH1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VWA8A3KMH1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VWA8A3KMH1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VWA8A3KMH1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VWA8A3KMH1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
VWA8A3KMH1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VWA8A3KMH1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VWA8A3KMH1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VWA8A3KMH1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VWA8A3KMH1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VWA8A3KMH1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
VWA8A3KMH1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VWA8A3KMH1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VWA8A3KMH1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VWA8A3KMH1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VWA8A3KMH1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VWA8A3KMH1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VWA8A3KMH1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VWA8A3KMH1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VWA8A3KMH1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
VWA8A3KMH1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VWA8A3KMH1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VWA8A3KMH1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
VWA8A3KMH1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA8A3KMH1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA8A3KMH1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA8A3KMH1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA8A3KMH1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA8A3KMH1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA8A3KMH1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA8A3KMH1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
VWA8A3KMH1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWA8A3KMH1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWA8A3KMH1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWA8A3KMH1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWA8A3KMH1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWA8A3KMH1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
VWA8A3KMH1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
VWA8A3KMH1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWA8A3KMH1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8952.1 ms