Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS05

TRBV5-7, T-cell receptor beta variable 5-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-7A0A0A0MS05 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV5-7A0A0A0MS05 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV5-7A0A0A0MS05 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV5-7A0A0A0MS05 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV5-7A0A0A0MS05 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV5-7A0A0A0MS05 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV5-7A0A0A0MS05 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV5-7A0A0A0MS05 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV5-7A0A0A0MS05 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV5-7A0A0A0MS05 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV5-7A0A0A0MS05 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV5-7A0A0A0MS05 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV5-7A0A0A0MS05 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV5-7A0A0A0MS05 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV5-7A0A0A0MS05 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV5-7A0A0A0MS05 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV5-7A0A0A0MS05 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV5-7A0A0A0MS05 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV5-7A0A0A0MS05 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV5-7A0A0A0MS05 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV5-7A0A0A0MS05 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV5-7A0A0A0MS05 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV5-7A0A0A0MS05 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV5-7A0A0A0MS05 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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