Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 NDUFV2-203ENST00000465096 643 ntTSL 25.38□□□□□ -1.551e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 CSDE1-208ENST00000524652 562 ntTSL 44.5□□□□□ -1.691e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 LMNA-211ENST00000470199 551 ntTSL 417.83■□□□□ 0.444e-11■□□□□ 9
PUM1Q14671 LMNA-219ENST00000502751 570 ntTSL 417.29■□□□□ 0.364e-11■□□□□ 9
PUM1Q14671 LMNA-210ENST00000469565 591 ntTSL 414.03□□□□□ -0.164e-11■□□□□ 9
PUM1Q14671 LMNA-214ENST00000478063 285 ntTSL 512.37□□□□□ -0.434e-11■□□□□ 9
PUM1Q14671 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.411e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.171e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.261e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.41e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.461e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.521e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 NACA-212ENST00000549259 690 ntTSL 510.27□□□□□ -0.775e-44■□□□□ 9
PUM1Q14671 NASP-205ENST00000437901 874 ntTSL 511.74□□□□□ -0.531e-11■□□□□ 9
PUM1Q14671 NASP-204ENST00000437362 999 ntTSL 211.72□□□□□ -0.531e-11■□□□□ 9
PUM1Q14671 NASP-212ENST00000527359 743 ntTSL 311.52□□□□□ -0.571e-11■□□□□ 9
PUM1Q14671 NASP-216ENST00000528238 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.51□□□□□ -0.731e-11■□□□□ 9
PUM1Q14671 NASP-206ENST00000453748 2080 ntTSL 29.58□□□□□ -0.881e-11■□□□□ 9
PUM1Q14671 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.172e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.022e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 BRD2-212ENST00000482914 4834 ntTSL 1 (best)13.3□□□□□ -0.282e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 BRD2-204ENST00000449025 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.46□□□□□ -0.572e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 BRD2-205ENST00000449085 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.572e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 BRD2-203ENST00000395287 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.822e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 CHMP2A-204ENST00000597848 509 ntTSL 321.53■■□□□ 1.045e-9■□□□□ 9
PUM1Q14671 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.315e-9■□□□□ 9
PUM1Q14671 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.355e-9■□□□□ 9
PUM1Q14671 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.435e-9■□□□□ 9
PUM1Q14671 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.445e-9■□□□□ 9
PUM1Q14671 CHMP2A-207ENST00000600804 592 ntTSL 212.13□□□□□ -0.475e-9■□□□□ 9
PUM1Q14671 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.485e-9■□□□□ 9
PUM1Q14671 COPB2-202ENST00000502734 680 ntTSL 29.64□□□□□ -0.875e-13■□□□□ 9
PUM1Q14671 CDK5RAP2-216ENST00000483412 6235 ntTSL 1 (best)9.33□□□□□ -0.926e-17■□□□□ 9
PUM1Q14671 CDK5RAP2-204ENST00000416449 3902 ntTSL 57.73□□□□□ -1.176e-17■□□□□ 9
PUM1Q14671 DYNC1I2-220ENST00000470286 587 ntTSL 47.59□□□□□ -1.197e-9■□□□□ 9
PUM1Q14671 DYNC1I2-224ENST00000482454 2590 ntTSL 1 (best)7.07□□□□□ -1.287e-9■□□□□ 9
PUM1Q14671 COPB2-210ENST00000512309 565 ntTSL 56.64□□□□□ -1.355e-13■□□□□ 9
PUM1Q14671 SLTM-225ENST00000560695 594 ntTSL 26.61□□□□□ -1.355e-9■□□□□ 9
PUM1Q14671 SLTM-214ENST00000558052 806 ntTSL 26.55□□□□□ -1.365e-9■□□□□ 9
PUM1Q14671 MYL12A-203ENST00000577510 567 ntTSL 25.19□□□□□ -1.585e-13■□□□□ 9
PUM1Q14671 COPB2-203ENST00000503326 433 ntTSL 34.63□□□□□ -1.675e-13■□□□□ 9
PUM1Q14671 URI1-211ENST00000575242 1032 ntTSL 212.01□□□□□ -0.494e-17■□□□□ 9
PUM1Q14671 CAPRIN1-217ENST00000534825 668 ntTSL 318.46■□□□□ 0.551e-10■□□□□ 9
PUM1Q14671 STMN1-208ENST00000485226 449 ntTSL 27.71□□□□□ -1.184e-22■□□□□ 9
PUM1Q14671 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.015e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 THOP1-203ENST00000585338 761 ntTSL 326.59■■□□□ 1.852e-10■□□□□ 9
PUM1Q14671 THOP1-204ENST00000585673 784 ntTSL 325.86■■□□□ 1.732e-10■□□□□ 9
PUM1Q14671 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.012e-10■□□□□ 9
PUM1Q14671 SNRNP25-201ENST00000293861 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)20.26■□□□□ 0.832e-10■□□□□ 9
PUM1Q14671 UPF3A-203ENST00000474056 748 ntTSL 318.62■□□□□ 0.572e-10■□□□□ 9
PUM1Q14671 FASN-207ENST00000635197 627 ntTSL 316.98■□□□□ 0.312e-10■□□□□ 9
PUM1Q14671 SNRNP25-203ENST00000397876 831 ntTSL 315.37■□□□□ 0.052e-10■□□□□ 9
PUM1Q14671 UPF3A-210ENST00000493727 937 ntTSL 512.98□□□□□ -0.332e-10■□□□□ 9
PUM1Q14671 SNRNP25-207ENST00000493672 329 ntTSL 512.62□□□□□ -0.392e-10■□□□□ 9
PUM1Q14671 SNRNP25-204ENST00000417493 408 ntTSL 511.32□□□□□ -0.62e-10■□□□□ 9
PUM1Q14671 FASN-213ENST00000637693 100 ntTSL 59.08□□□□□ -0.962e-10■□□□□ 9
PUM1Q14671 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.332e-6■□□□□ 9
PUM1Q14671 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.332e-6■□□□□ 9
PUM1Q14671 DDX17-203ENST00000403230 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15.71■□□□□ 0.112e-6■□□□□ 9
PUM1Q14671 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.172e-6■□□□□ 9
PUM1Q14671 DDX17-201ENST00000216019 6441 ntTSL 1 (best)12.58□□□□□ -0.42e-6■□□□□ 9
PUM1Q14671 DDX17-205ENST00000432525 1354 ntTSL 210.65□□□□□ -0.72e-6■□□□□ 9
PUM1Q14671 DYNC1I2-215ENST00000438879 808 ntTSL 510.68□□□□□ -0.76e-8■□□□□ 9
PUM1Q14671 CDC45-204ENST00000428937 577 ntTSL 517.89■□□□□ 0.458e-8■□□□□ 9
PUM1Q14671 RPL14-204ENST00000435633 966 ntTSL 222.7■■□□□ 1.221e-323■□□□□ 9
PUM1Q14671 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.091e-323■□□□□ 9
PUM1Q14671 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.131e-323■□□□□ 9
PUM1Q14671 RPL14-208ENST00000479563 794 ntTSL 1 (best)13□□□□□ -0.331e-323■□□□□ 9
PUM1Q14671 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.271e-323■□□□□ 9
PUM1Q14671 GNAS-233ENST00000476935 828 ntTSL 324.87■■□□□ 1.571e-14■□□□□ 9
PUM1Q14671 GNAS-248ENST00000488652 953 ntTSL 522.21■■□□□ 1.151e-14■□□□□ 9
PUM1Q14671 AP2A1-205ENST00000597774 2196 ntTSL 516.54■□□□□ 0.241e-6■□□□□ 9
PUM1Q14671 CDC45-208ENST00000471470 857 ntTSL 512.11□□□□□ -0.475e-13■□□□□ 9
PUM1Q14671 AP2A1-201ENST00000354293 3388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.631e-6■□□□□ 9
PUM1Q14671 GNAS-245ENST00000487862 1782 ntTSL 211.11□□□□□ -0.631e-14■□□□□ 9
PUM1Q14671 GNAS-253ENST00000493958 534 ntTSL 211.1□□□□□ -0.631e-14■□□□□ 9
PUM1Q14671 AP2A1-202ENST00000359032 3286 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.661e-6■□□□□ 9
PUM1Q14671 GNAS-232ENST00000476196 1839 ntTSL 210.69□□□□□ -0.71e-14■□□□□ 9
PUM1Q14671 GNAS-251ENST00000492907 790 ntTSL 39.59□□□□□ -0.871e-14■□□□□ 9
PUM1Q14671 GNAS-254ENST00000494081 557 ntTSL 58.35□□□□□ -1.071e-14■□□□□ 9
PUM1Q14671 GNAS-255ENST00000496934 2837 ntTSL 26.49□□□□□ -1.371e-14■□□□□ 9
PUM1Q14671 UAP1-205ENST00000474728 660 ntTSL 26.29□□□□□ -1.45e-13■□□□□ 9
PUM1Q14671 PCBP2-214ENST00000549272 445 ntTSL 25.85□□□□□ -1.475e-13■□□□□ 9
PUM1Q14671 NASP-202ENST00000351223 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.729e-12■□□□□ 9
PUM1Q14671 NASP-224ENST00000537798 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.129e-12■□□□□ 9
PUM1Q14671 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.169e-12■□□□□ 9
PUM1Q14671 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.249e-12■□□□□ 9
PUM1Q14671 EEF1D-241ENST00000531931 614 ntTSL 323.42■■□□□ 1.347e-10■□□□□ 9
PUM1Q14671 EEF1D-244ENST00000532543 791 ntTSL 318.08■□□□□ 0.487e-10■□□□□ 9
PUM1Q14671 EEF1D-210ENST00000525223 610 ntTSL 313.31□□□□□ -0.287e-10■□□□□ 9
PUM1Q14671 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.695e-9■□□□□ 9
PUM1Q14671 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.695e-9■□□□□ 9
PUM1Q14671 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.445e-9■□□□□ 9
PUM1Q14671 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.255e-9■□□□□ 9
PUM1Q14671 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.185e-9■□□□□ 9
PUM1Q14671 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.145e-9■□□□□ 9
PUM1Q14671 MAZ-204ENST00000561855 672 ntTSL 513.7□□□□□ -0.225e-9■□□□□ 9
PUM1Q14671 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.132e-13■□□□□ 9
PUM1Q14671 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.832e-13■□□□□ 9
PUM1Q14671 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.812e-13■□□□□ 9
Retrieved 100 of 12,080 protein–RNA pairs in 204.7 ms