RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476935.5

GNAS-233, Transcript of GNAS complex locus, human

TSL 3

Gene GNAS, Length 828 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNAS-233	ENST00000476935	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		58.61	■■■■■ 6.97
GNAS-233	ENST00000476935	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		52.36	■■■■■ 5.97
GNAS-233	ENST00000476935	ABCC9	O60706	1549 aa		51.71	■■■■■ 5.87
GNAS-233	ENST00000476935	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		49.54	■■■■■ 5.52
GNAS-233	ENST00000476935	NACAD	O15069	1562 aa		49.36	■■■■■ 5.49
GNAS-233	ENST00000476935	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		49.19	■■■■■ 5.47
GNAS-233	ENST00000476935	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		48.92	■■■■■ 5.42
GNAS-233	ENST00000476935	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	48.67	■■■■■ 5.38
GNAS-233	ENST00000476935	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		48.49	■■■■■ 5.35
GNAS-233	ENST00000476935	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		48.43	■■■■■ 5.34
GNAS-233	ENST00000476935	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	48.24	■■■■■ 5.31
GNAS-233	ENST00000476935	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		48.05	■■■■■ 5.28
GNAS-233	ENST00000476935	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		48.01	■■■■■ 5.28
GNAS-233	ENST00000476935	SCRIB	Q14160	1630 aa		47.67	■■■■■ 5.22
GNAS-233	ENST00000476935	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		47.53	■■■■■ 5.2
GNAS-233	ENST00000476935	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	46.82	■■■■■ 5.09
GNAS-233	ENST00000476935	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		46.77	■■■■■ 5.08
GNAS-233	ENST00000476935	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		46.55	■■■■■ 5.04
GNAS-233	ENST00000476935	SMARCA4	P51532	1647 aa		45.59	■■■■■ 4.89
GNAS-233	ENST00000476935	NCAPD3	P42695	1498 aa		45.56	■■■■■ 4.88
GNAS-233	ENST00000476935	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		45.48	■■■■■ 4.87
GNAS-233	ENST00000476935	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	45.46	■■■■■ 4.87
GNAS-233	ENST00000476935	SMARCA2	P51531	1590 aa		45.41	■■■■■ 4.86
GNAS-233	ENST00000476935	HMGXB3	Q12766	1538 aa		45.26	■■■■■ 4.84
GNAS-233	ENST00000476935	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		45.17	■■■■■ 4.82
GNAS-233	ENST00000476935	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		45.14	■■■■■ 4.82
GNAS-233	ENST00000476935	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	45.06	■■■■■ 4.8
GNAS-233	ENST00000476935	WIZ	O95785	1651 aa		44.63	■■■■■ 4.73
GNAS-233	ENST00000476935	ERCC6	Q03468	1493 aa		44.62	■■■■■ 4.73
GNAS-233	ENST00000476935	NES	P48681	1621 aa		44.59	■■■■■ 4.73
GNAS-233	ENST00000476935	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		44.44	■■■■■ 4.71
GNAS-233	ENST00000476935	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	44.43	■■■■■ 4.7
GNAS-233	ENST00000476935	CUX2	O14529	1486 aa		44.39	■■■■■ 4.7
GNAS-233	ENST00000476935	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		44.2	■■■■■ 4.67
GNAS-233	ENST00000476935	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		44.17	■■■■■ 4.66
GNAS-233	ENST00000476935	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	44.12	■■■■■ 4.65
GNAS-233	ENST00000476935	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		44.07	■■■■■ 4.64
GNAS-233	ENST00000476935	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	44.04	■■■■■ 4.64
GNAS-233	ENST00000476935	CFTR	P13569	1480 aa		43.82	■■■■■ 4.6
GNAS-233	ENST00000476935	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		43.71	■■■■■ 4.59
GNAS-233	ENST00000476935	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		43.71	■■■■■ 4.59
GNAS-233	ENST00000476935	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		43.67	■■■■■ 4.58
GNAS-233	ENST00000476935	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		43.66	■■■■■ 4.58
GNAS-233	ENST00000476935	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		43.62	■■■■■ 4.57
GNAS-233	ENST00000476935	WDR62	O43379	1518 aa		43.59	■■■■■ 4.57
GNAS-233	ENST00000476935	PRDM2	Q13029	1718 aa		43.46	■■■■■ 4.55
GNAS-233	ENST00000476935	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	43.26	■■■■■ 4.52
GNAS-233	ENST00000476935	ABCC8	Q09428	1581 aa		42.93	■■■■■ 4.46
GNAS-233	ENST00000476935	TOPBP1	Q92547	1522 aa		42.92	■■■■■ 4.46
GNAS-233	ENST00000476935	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	42.89	■■■■■ 4.46
GNAS-233	ENST00000476935	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		42.82	■■■■■ 4.44
GNAS-233	ENST00000476935	IFT140	Q96RY7	1462 aa		42.79	■■■■■ 4.44
GNAS-233	ENST00000476935	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	42.61	■■■■■ 4.41
GNAS-233	ENST00000476935	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	42.5	■■■■■ 4.39
GNAS-233	ENST00000476935	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	42.49	■■■■■ 4.39
GNAS-233	ENST00000476935	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		42.49	■■■■■ 4.39
GNAS-233	ENST00000476935	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	42.41	■■■■■ 4.38
GNAS-233	ENST00000476935	CUX1	P39880	1505 aa		42.37	■■■■■ 4.37
GNAS-233	ENST00000476935	SOGA1	O94964	1423 aa		42.35	■■■■■ 4.37
GNAS-233	ENST00000476935	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	42.32	■■■■■ 4.37	1e-9	■■■□□ 16.6
GNAS-233	ENST00000476935	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		42.32	■■■■■ 4.37
GNAS-233	ENST00000476935	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		42.32	■■■■■ 4.37
GNAS-233	ENST00000476935	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	42.15	■■■■■ 4.34
GNAS-233	ENST00000476935	WDR97	A6NE52	1622 aa		42.15	■■■■■ 4.34
GNAS-233	ENST00000476935	CHD1	O14646	1710 aa		42.01	■■■■■ 4.32
GNAS-233	ENST00000476935	TRIM41	Q8WV44	630 aa		41.96	■■■■■ 4.31
GNAS-233	ENST00000476935	FBLN2	P98095	1184 aa		41.93	■■■■■ 4.3
GNAS-233	ENST00000476935	GRIN2B	Q13224	1484 aa		41.92	■■■■■ 4.3
GNAS-233	ENST00000476935	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	41.91	■■■■■ 4.3	3e-6	■□□□□ 10.3
GNAS-233	ENST00000476935	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		41.9	■■■■■ 4.3
GNAS-233	ENST00000476935	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		41.9	■■■■■ 4.3
GNAS-233	ENST00000476935	TOP2B	Q02880	1626 aa		41.88	■■■■■ 4.3
GNAS-233	ENST00000476935	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		41.88	■■■■■ 4.3
GNAS-233	ENST00000476935	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	41.86	■■■■■ 4.29
GNAS-233	ENST00000476935	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		41.85	■■■■■ 4.29
GNAS-233	ENST00000476935	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		41.81	■■■■■ 4.28
GNAS-233	ENST00000476935	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		41.81	■■■■■ 4.28
GNAS-233	ENST00000476935	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		41.81	■■■■■ 4.28
GNAS-233	ENST00000476935	SYNJ1	O43426	1573 aa		41.8	■■■■■ 4.28
GNAS-233	ENST00000476935	PBRM1	Q86U86	1689 aa		41.77	■■■■■ 4.28
GNAS-233	ENST00000476935	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		41.77	■■■■■ 4.28
GNAS-233	ENST00000476935	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	41.76	■■■■■ 4.28
GNAS-233	ENST00000476935	ARHGEF11	O15085	1522 aa		41.74	■■■■■ 4.27
GNAS-233	ENST00000476935	SYNJ2	O15056	1496 aa		41.7	■■■■■ 4.27
GNAS-233	ENST00000476935	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		41.54	■■■■■ 4.24
GNAS-233	ENST00000476935	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		41.41	■■■■■ 4.22
GNAS-233	ENST00000476935	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		41.4	■■■■■ 4.22
GNAS-233	ENST00000476935	ADAMTS12	P58397	1594 aa		41.39	■■■■■ 4.22
GNAS-233	ENST00000476935	ARAP1	Q96P48	1450 aa		41.36	■■■■■ 4.21
GNAS-233	ENST00000476935	GRIN2A	Q12879	1464 aa		41.35	■■■■■ 4.21
GNAS-233	ENST00000476935	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		41.35	■■■■■ 4.21
GNAS-233	ENST00000476935	NUP160	Q12769	1436 aa		41.21	■■■■■ 4.19
GNAS-233	ENST00000476935	CEP170	Q5SW79	1584 aa		41.16	■■■■■ 4.18
GNAS-233	ENST00000476935	KIF27	Q86VH2	1401 aa		41.1	■■■■■ 4.17
GNAS-233	ENST00000476935	IGF1R	P08069	1367 aa		41	■■■■■ 4.15
GNAS-233	ENST00000476935	SHROOM2	Q13796	1616 aa		40.96	■■■■■ 4.15
GNAS-233	ENST00000476935	CUL7	Q14999	1698 aa		40.91	■■■■■ 4.14
GNAS-233	ENST00000476935	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		40.91	■■■■■ 4.14
GNAS-233	ENST00000476935	JPH4	Q96JJ6	628 aa		40.82	■■■■■ 4.13
GNAS-233	ENST00000476935	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		40.79	■■■■■ 4.12

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